A főtanácsadót azt követően kereste meg a távirati iroda, hogy az Index azt írta: Braun Róbert lemondása mögött az áll, hogy "az elmúlt hónapokban szervezeti és stratégiai kérdésekben képviselt véleménye jelentősen eltért Gyurcsány Ferenc álláspontjától". A főtanácsadó ezt az állítást az MTI kérdésére nem kívánta értelmezni.
László Boglár kormányszóvivő szerint Braun Róbert kedden kérte felmentését, távozási szándékát Gyurcsány Ferenc miniszterelnök elfogadta. Távozásának semmilyen szakmai oka nincsen, a főtanácsadó kérésének kizárólag személyes indokai vannak - hangsúlyozta a kormányszóvivő. Elmondta azt is, hogy Braun Róbertnek, főtanácsadói besorolása miatt, nem jár végkielégítés.
Braunt 2003. február 1-jei hatállyal, Medgyessy Péter miniszterelnöksége idején nevezték ki helyettes államtitkárnak. Korábban az Index igazgatója és az SZDSZ kabinetfőnöke volt. A Miniszterelnöki Hivatal helyettes államtitkári posztjáról 2004 májusában mondott le, akkori lapértesülések szerint távozásának oka az volt, hogy "Medgyessy Péter miniszterelnök környezetéből rengeteg támadás érte".
Medgyessy Péter lemondását követően Braun 2004 októberében kapta meg az új kormányfőtől, Gyurcsány Ferenctől a főtanácsadói megbízatást.