Csökkentett sebességgel közlekednek a vonatok a Budapest-Győr, a Szerencs-Sátoraljaújhely és a Baja-Pörböly vonalakon.
A Budapest-Komárom-Győr vasútvonalon Komárom és Almásfüzitő között kissé felemelhették a vonatok sebességét: a korábbi húsz helyett immár negyven kilométeres óránkénti sebességre. A belföldi és nemzetközi IC, EC vonatok változatlan menetrend szerint, de késéssel közlekednek.
Az erre közlekedő belföldi gyorsvonatok – a menetrendtől eltérően – megállnak Almásfüzitőn, Almásfüzitő felsőn és Szőnynél, és emiatt menetidejük is meghosszabbodik. A személyvonatok helyett Almásfüzitő és Komárom között vonatpótló autóbuszok szállítják az utasokat.
Almásfüzitő és Esztergom között is fokozott felügyeletet tart a MÁV március 30-tól. Április elsején Almásfüzitő és Tokod között a magas vízállás miatt a vonalat lezárták a forgalom elől, Neszmély után víz alá került a vasúti pályatest is. A vasúti szakaszon lévő hidakra – a védelem érdekében – egy-egy zúzottkővel rakott kocsit állítottak. Vonatpótló autóbuszok a közúti lezárások miatt nem járhatnak. Az utazni szándékozók a Volán-járatokkal közlekedhetnek, a buszjáratokra a MÁV bérlet érvényes.
A Bodrog magas vízállása miatt Sárospatak és Sátoraljaújhely között április elsején ideiglenes sebességkorlátozást vezetett be a vasúttársaság, ott jelenleg 10 kilométeres óránkénti sebességgel közlekedhetnek a szerelvények. Ezen a szakaszon beszűntették a teherszállítást is.
Baja és Pörböly között a vonatok húsz kilométeres óránkénti sebességgel közlekedhetnek, a menetidő így meghosszabbodik. A térségben a közúti forgalom is akadályokba ütközik, ezért a Volán bérletek a vonatokra érvényesek.
A Felső-Tiszán az árhullám miatt vasútvonalakon korlátozásra nem került sor, azonban a Tisza középső- és alsó folyásszakaszán a védelemre való felkészülést megkezdte a MÁV - áll a tájékoztatóban.
A Bodrogon és a Tiszán egyidejűleg levonuló árhullám a Tokaj-Rakamaz árterületet várhatóan tartósan elönti, ami miatt - a vízszint függvényében - ezen a vasúti szakaszon is sebességkorlátozást vezetnek be. A vonatok ott mindössze 40 kilométeres óránkénti sebességgel közlekedhetnek.