Pálinkás József szerint a mostani kutatóintézet-hálózat infrastruktúrája szétaprózott, rugalmatlan, ami megnehezíti a kutatási témaváltást, a csökkenő források túl nagy részét emésztik fel az adminisztratív költségek. Az átalakítások során az eddigi 38 kutatóintézetből és két kutatóközpontból álló hálózat helyett 5 kutatóintézetet és 10 kutatóközpontot magába foglaló struktúra jön létre. Az MTA jelenlegi 18 egyéb költségvetési szerveinek számát kilenc csökkentik, így az eredeti 58 költségvetési szervből 24 alakul.

Az elnök összesen kilenc fórumot tartott a kilenc új kutatóközpont munkatársaival. A rendezvények célja, hogy a kutatókkal közvetlenül ismertesse a megújítás menetét, az érintettek pedig  közvetlenül kérdezhessenek az őket érintő kérdésekről. Pálinkás József azt mondta: világossá tette, hogy 15 kutatóintézet és központ lesz, ugyanakkor a kutatásban, a kutatómunkában szükséges autonómia megmarad.

A kutatóintézetekből 140 adminisztratív dolgozót, az egyéb intézményekből nyolcvanat bocsátanak el. A strukturális megújulás első lépésével megtakarítható félmilliárd forint a kutatásokra fordítható forrásokat növeli – tette hozzá.

"A reakcióból úgy értékelem, hogy a kutatók örültek ezeknek a fórumoknak, látják a célokat, azt, hogy egy végiggondolt, a kutatóhálózat érdekében történő átalakítást hajtunk végre, amely során maximálisan igyekszünk figyelembe venni az egyéni szempontokat" - fogalmazott Pálinkás József.

Az elnök hozzátette: voltak viták is. "Örülök a vitának, mert egy ilyen mértékű átalakításnál szükséges, hogy világosan beszéljünk egymással. Úgy vélem, hogy sikerült az aggodalmakat eloszlatni" – véli Pálinkás József.