George Little szerint a Pentagon főfelügyelője már tájékoztatta Leon Panetta védelmi minisztert a vizsgálat eredményeiről, arról, hogy John Allen vétlen. A tárcavezető elégedettségének adott hangot amiatt, hogy a nyomozás során nem bizonyosodott be a tábornokkal szemben felmerült gyanú.

A nős, kétgyermekes családapa most az afganisztáni amerikai és NATO-erők parancsnoka. A nyomozás idején a tábornok a posztján maradt, de az eljárás késleltette kinevezését az európai NATO-erők élére.

Az ügyön tizenöt nyomozó dolgozott éjt nappallá téve. A vizsgálat célja annak megállapítása volt, hogy történt-e "nem megfelelő" levelezés a tábornok és a Floridában állomásozó amerikai fegyveres erőket önkéntesként támogató nő között. Konkrétabban az, hogy Allen az üzenetváltással megsértette-e a védelmi minisztériumi vagy a kormányzati előírásokat, esetleg a fegyveres erőkre vonatkozó törvényeket.     

Korábbi hírek szerint a novemberben indult vizsgálat során a Pentagon nyomozóinak körülbelül 20-30 ezer e-mailt kellett átfésülniük, később azonban 60-70 elektronikus küldeményre szűkült a nyomozás. Bennfentes minisztériumi illetékesek azt mondták, hogy egyes e-mailekből ítélve a tábornok flörtölt ugyan a hölggyel, de a főfelügyelő megállapította, hogy nem vétett a szabályok ellen.

Allen és Kelley levelezése a Központi Hírszerző Ügynökség (CIA) lemondott igazgatója, David Petraeus körül kirobbant szexbotrány mellékszálaként lepleződött le. Petraeus házasságtörő viszonyára úgy derült fény, hogy valaki névtelen fenyegető üzeneteket küldött Kelleynek: tartsa magát távol a hírszerzés főnökétől. A Szövetségi Nyomozó Iroda (FBI) a floridai nő segélykérése nyomán vizsgálatot indított, amely megállapította, hogy a figyelmeztetések Paula Broadwelltől származnak, aki a CIA első emberének életrajzírója és szeretője volt.