A rektor emlékeztetett rá, hogy azok a felsőoktatási intézmények, amelyek a Magyar Akkreditációs Bizottság (MAB) által akkreditált doktori programmal rendelkeztek 1997-ben, megkapták a jogot a Magyarországon bevezetett PhD tudományos fokozat kiállítására, valamint 1997 és 1999 között a korábban megszerzett tudományos fokozatok átminősítésére is.

Az átminősítést egy nemzetközi szakértői bizottság végezte, a rektor közleménye szerint így az átminősítési eljárás minden tekintetben megfelelt a hatályos egyházi és állami előírásoknak. A rektor hozzáteszi, mivel "hittudományi tudományág" nem szerepelt a hazai tudományági felsorolásban, ezért a MAB "vallástudományi doktori programként" ismerte el a hittudományi képzést, így Semjén Zsolt doktoriját is.

Semjén Zsolt korábbi tudományos fokozatát ezen szabályok szerint 1997-ben minősítették át PhD-vé, ezt az átminősítő okiratot Erdő Péter, a hittudmányi kar akkori dékánja írta alá.

A ELTE szociológiai tanszék vezetője a Népszabadságnak felidézte, hogy Semjén dolgozatával kapcsolatban súlyos kifogások fogalmazódtak meg, az egyik kijelölt opponens elégtelent adott a dolgozatra. Mint Fokasz Nikosz mondta, nem formai, hanem témabeli problémák voltak, az opponens ugyanis nem szociológiai, hanem teológiai dolgozatnak ítélte meg. A Népszabadság információi szerint a mai egyetemi kari értekezleten foglalkozhatnak Semjén szakdolgozatával.

Mint ismert, a hvg.hu vasárnap este azt írta, Semjén Zsolt 1991-ben megvédett hittudományi doktori dolgozatának közel negyven százalékát magyar, német és angol nyelvű források átvétele adta. Az akkor megszerzett doktori fokozatát 1997-ben minősítette át az egyetem PhD fokozattá. Semjén 1992-ben a szociológia szakon leadott diplomamunkája jelentős átfedést mutat egy évvel korábbi teológiai értekezésével is.