Aki a Lion telepítésekor nem vette igénybe a felkínált titkosítási szolgáltatást, az ezt később is könnyen és zökkenőmentesen megteheti. A FileVault2 bekapcsolását a System Preferences/Security & Privacy/FileVault oldalon lehet megtenni. A Lion rendszerlemez teljes titkosításához csak meg kell nyomni a Turn On FileVault gombot.

Ekkor kapunk egy úgynevezett recovery key-t, amit érdemes leírni és egy biztonságos helyre tenni, mert ha elfelejtjük a jelszót, akkor csak ennek a kulcsnak a megadásával fogunk hozzáférni adatainkhoz. A titkosítási folyamat egy újraindítással fog kezdődni, de ekkor már csak jelszóval tudunk belépni az operációs rendszerbe. A titkosítás közben nyugodtan dolgozhatunk tovább, a FileVault  menü panelján mindig látni fogjuk hogy mennyi idő van még hátra a művelet teljes befejezéséig. Közben nyugodtan dolgozhatunk, a lemez titkosítása teljesen észrevétlenül fog zajlani, éppen úgy mint majd a titkosított lemez használata.