Bár a krónika már évszázadok óta arról szólt, hogy ide temették a 65-ben Néró császár idején lefejezett szentet, ennek bizonyítéka csak nemrég akadt. 2002-ben a vatikáni régészeti szolgálat ásatásokat kezdett a bazilika főoltára alatt és akkor vált láthatóvá a márványszarkofág, amelynek oldalán a latin nyelvű felirat arról tanúskodik, hogy a mártír Pál apostol nyugszik benne. A sírt azonban formálisan csak 2005-ben nyilvánította Szent Pálénak az egyház - írta meg az El País című spanyol napilap.
A sír most már megtekinthető - jelentette be Andrea Cordero Lanza Montezemolo bíboros, aki elmondta: az egyháznak nincs kétsége afelől, hogy a szent sírját találták meg, ezért pillanatnyilag nem nyitják fel, hogy az azonosítást elvégezzék. Nem zárta ki azonban, hogy később, ha meglesznek a szükséges engedélyek, tudományos vizsgálatot kezdenek. Engedélyt a szarkofág kinyitására csak a pápa adhat. Radiosugarakkal ugyan már megpróbáltak betekinteni a szarkofágba, a márvány vastagsága miatt azonban ez nem hozott semmiféle eredményt.
A római Szent Pál bazilikát, a Szent Péter Bazilika után a második legnagyobb katolikus templomot annak a templomnak a romjaira építették, amelyet a 4. században emeltek, még Constantinus császár alatt. Az idők során a szarkofág 1,3 méter mélyre süllyedt a földbe.
