A lázadást a hadsereg és rendőrség helyi erői egy nap alatt leverték, de a kisebb összetűzések azóta sem szűnnek. A városban ivatalosan meg nem erősített források szerint legalább 500 embert megöltek, és 2000-en megsebesültek, ugyanakkor egy emberi jogi szervezet andizsáni vezetője hétfőn arról számolt be, hogy szombaton az Andizsántól 30 kilométerre észak-keletre fekvő Pahtabádban a hadsereg 200 tüntetőt ölt meg.

Az áldozatok és a sérültek száma azonban még tisztázatlan. Egy helyi illetékes Zakir Almatov üzbég belügyminiszter adataira hivatkozva hétfőn azt mondta, hogy több mint hetvenen haltak meg a négy nappal ezelőtti andizsáni tűzharcban. A névtelenségbe burkolózó tisztviselő szerint a belügyminiszter vasárnap tette közzé ezeket az adatokat a legfőbb tartományi vezetőkkel való találkozóján. Ugyanekkor jelentette be Almatov azt is, hogy 70 "rendzavarót" letartóztattak.

Iszlam Karimov üzbég elnök az iszlám aktivistákat tette felelősség az erőszakos cselekményekért. Közben a szomszédos Kirgizisztánban állomásozó diplomaták szerint hétfőre virradóra lövéseket lehetett hallani a kirgiz-üzbég határon lévő, egy csatornával elválasztott Kara-szu városában, ahol "igen feszültté vált a helyzet". A város üzbég felén szombaton a tüntetők felégették a helyi rendőrkapitányság, valamint az adóhivatal épületét.

Mintegy 900 üzbégnek sikerült eddig átmenekülnie Kirgizisztánba, ahol a hatóságok sátortábort nyitottak számukra.