Az ügyben az igazgatóság munkatársai feljelentés és bejelentések alapján indítottak nyomozást, ennek fokozott ügyészi felügyeletét a Szegedi Járási Ügyészség látta el.
A pénzügyi nyomozók megvizsgálták a könyvelési anyagokat, valamint az egyházmegye és a hozzá kapcsolódó gazdasági társaságok és intézmények korábbi ellenőrzési iratait, és tanúkat is kihallgattak.
A vizsgálat alapján egyrészt nem állapítható meg bűncselekmény elkövetése, másrészt a feljelentésben és a bejelentésekben leírtak nem minősülnek bűncselekménynek.