A korszerűsítés után az állandó kiállítás területe jelentősen, az időszaki tárlatoké több mint kétszeresére nő. Harminc év után megújítják az itt bemutatott állandó kiállítást is.
Az egykor a pannonhalmi főapát győri rezidenciájaként szolgáló épület történelmi és kulturális szempontból is meghatározó szerepet játszik a belvárosban, amelyet 2006 óta folyamatosan újítgatnak.
Már készülnek az engedélyeztetési tervek, amelyek eredményeként egy 21. századi igényeknek megfelelő múzeumépületet avathatnak fel két év múlva. Fekete Dávid alpolgármester úgy nyilatkozott, hogy 2014-2015 fordulóján születhet meg a pályázati döntés a projekt támogatásáról.
Grászli Bernadett, az egykori megyei múzeumot is magában foglaló Rómer Flóris Városi Művészeti és Történeti Múzeum igazgatója bejelentette, hogy március 20-án bezárják a legutóbb 1983-ban felújított Apátúr-ház kiállításait. Ezután megkezdik a tárgyak csomagolását, elszállítását, valamint a korábban az épület többször átalakított falainak kutatását.
Az igazgató azt ígérte: amit lehet, azt eredeti állapotába állítják vissza az épületet. Példaként említette, hogy a ház ma díszteremként szolgáló egykori ebédlőjében korhű állapotok maradtak meg, ugyanakkor mostanra már semmi sem látható az apáti lakosztály freskóciklusaiból.
