Legalább húszan a szerdára virradó éjszakán vesztették életüket. Az éjszakai vérontás arab csoportok bosszúakciója volt a fővárosban élő, fekete bőrű dél-szudáni menekültek ellen. Szemtanúk szerint az éjszakai kijárási tilalom ellenére fegyveres polgári személyek randalíroztak egész éjszaka az utcákon, igyekezve megtorolni azt, ami hétfőn és kedden történt, amikor dél-szudániak öldököltek, bántalmaztak arabokat.
Fekete bőrű dél-szudáni menekültek tömegei tódultak hétfőn az utcákra, megtámadták az arab kinézetű járókelőket, gyújtogattak, törtek-zúztak annak a hírnek hallatán, hogy helikopter-szerencsétlenségben életét vesztette John Garang, Szudán első alelnöke. Garang a kormányellenes dél-szudáni lázadók vezére volt a muzulmán arab többség érdekeit képviselő kartúmi kormány és a keresztény, illetve animista, fekete bőrű déli lakosság fegyveres szervezetének több mint két évtizedig tartó harcában. A januári békeszerződés értelmében Garang Szudán első alelnökévé vált; a múlt hónapban vonult be híveinek tömegével Kartúmba, hogy átvegye a posztját.
Dél-szudániak nagy tömegei élnek Kartúmban. Nagy részük éppen a Szudán déli részén dúló háború elől menekült a fővárosba az utóbbi két évtized folyamán. Sokan közülük nem hisznek a kormány hivatalos közleményének, amely szerint közönséges légi szerencsétlenség okozta vezérük halálát. Feltételezik, hogy a januári békeegyezség és a színleg szívélyessé vált kapcsolat ellenére Omar el-Besir szudáni elnök tétette el láb alól korábbi ellenségét, az ország alelnökévé előlépett volt lázadóvezért.
Kezdetben a főváros központja volt a zavargások színhelye. Miután a nagy erőkkel kivonuló biztonsági alakulatok helyreállították a rendet a centrumban, újult erővel lángolt fel az erőszak Kartúm külvárosaiban. A lakosság egy része gépkocsin menekül a veszélyessé vált fővárosi körzetekből. Olaj volt a tűzre az a szerdán elterjedt híresztelés, hogy megölték Kartúmban a dél-szudáni fegyveres osztagok egyik parancsnokát. Noha nemcsak a szudáni külügyminisztérium, de a Dél-szudáni Védelmi Erők parancsnoksága is tagadta a híresztelést, annak hallatán újabb összecsapások robbantak ki több külvárosi körzetben.
Omar el-Besir szudáni elnök nyugalomra intette szerdán a főváros lakosságát. Bejelentette tv-beszédében, hogy vegyes bizottságot hoznak létre a kormány, illetve a dél-szudániak fő politikai ereje, a Szudáni Népi Felszabadítási Mozgalom (SPLM) megbízottaiból a helikopter-szerencsétlenség körülményeinek kivizsgálására. Salva Kiir tábornok - John Garang utódja a dél-szudáni mozgalom élén - szintén az erőszak beszüntetésére kérte a lakosságot. Azt mondta szerdai sajtóértekezletén, hogy a béke ellenségei igyekeznek hasznot húzni a helyzetből; meg akarják akadályozni a kormányt és az SPLM-et a januári békeegyezség rendelkezéseinek végrehajtásában. A norvég közvetítéssel tető alá hozott békeszerződés értelmében a keresztény és animista Dél megmarad a szudáni állam keretein belül, de nagyfokú önállóságot élvez, és megtarthatja a területén kitermelt olaj felét.