A botrány 2006 májusában pattant ki, amikor egy razzia során számos doppingkészítményt és körülbelül kétszáz vértasakot foglalt le a rendőrség több madridi lakásban. Később kiderült, hogy Fuentes többek között világhírű kerékpárosokkal - Jan Ullrichhal, Ivan Bassóval, Oscar Sevillával, Alejandro Valverdével, Jörg Jakschéval -, atlétákkal - például világbajnok Marta Dominguezzel -, valamint labdarúgókkal és más sportolókkal is kapcsolatban állt.

A bíróság várhatóan több tucat tanút hallgat ki a következő két hónapban.

Fuentes mellett testvére, az ugyancsak orvos Yolanda, az Once és a Liberty Seguros kerékpárcsapatot korábban igazgató Manolo Saiz, valamint a Kelme istálló két vezetője, Vicente Belda és Ignacio Labarta a gyanúsított.

Ha bűnösnek találják őket a sportolók egészségének - illetve életének - veszélyeztetésében, szabadságvesztésre ítélhetik őket a népegészségügyi törvények megsértése miatt. Az eljárás nem doppingolásra ösztönzés, hanem közreműködés doppingolásban bűncselekménye miatt folyik ellenük. Spanyolországban csak 2006 novemberében, hat hónappal az ügy kirobbanása után fogadtak el ugyanis doppingellenes törvényt.

Fuentes azt állítja, hogy az ő módszerei nem minősülnek doppingolásnak, és nem tiltott eszközökkel éri el a versenyzők teljesítményének fokozását.