A vasúton több helyen is kell számítani a menetrendtől eltérő közlekedésre, de nem baleset, hanem felújítások miatt. Nagymaros és Szob között például karbantartást végeznek, emiatt a Budapest-Vác-Szob vonalon módosított menetrend szerint járnak a vonatok.
Pályaépítési munkákat végeznek Sárbogárd és Baja között is. Itt december 7-ig Szekszárd és Bátaszék között vonatpótló autóbuszok szállítják az utasokat. A Gemenc InterCity csak Bátaszék és Budapest-Déli pályaudvar között közlekedik.
Ugyancsak pályakarbantartás miatt változik szerdától néhány éjszakai vonat közlekedése az újszászi vonalon.
Továbbra is csak egy vágányon közlekednek a vonatok pályaépítés miatt Martonvásár és Kápolnásnyék között, ezért a Budapest-Székesfehérvár vonal módosított menetrend szerint közlekednek a vonatok.