A kormány a Széll Kálmán Tervben azt vállalta, hogy összesen 83 milliárd forinttal javítja a gyógyszerkassza kiadási és bevételi oldalát együttesen. A költségvetési egyensúly problémái miatt a Széll Kálmán Terv 2.0-ban a kormány további 40 milliárd forintos megtakarítást írt elő, és ezt beírta a Konvergencia Programba is. Az előirányzott 277 milliárd forintból szeptember végéig bezárólag már 237 milliárdot költöttek el, amely a teljes keret több mint 85 százaléka. Év végére bizonyosan meghaladja majd a kiadás a tervezettet, méghozzá várhatóan 30 milliárd forinttal.

A kormány erre reagálva megemelte a kiadási előirányzatot, a bevételi oldalon pedig az eredeti 52 milliárd helyett 80 milliárdot szednek be a gyártóktól és forgalmazóktól, ellensúlyozva a megnövekedett kiadásokat. Ez az elmaradt reformok kármentése. A jövő évre tervezett 198 milliárdos előirányzat az ideihez képest 60 százalékos csökkenést jelent. Mindezt úgy kéne teljesíteni a kormányzatnak, hogy közben 30 milliárddal tervezte csökkenteni a gyógyszergyártói és forgalmazói befizetéseket. A kedvezőtlen költségvetési helyzetben feltételezhetően ismét a gyártóknak kell majd állnia az elmaradt átalakítások árát.

A kormány hangsúlyozza, hogy úgy alakította át a gyógyszerkasszát, hogy közben a betegek terhei nem növekedtek, bár a Policy Agenda kutatásai mást mutatnak. 2000-ben még átlagosan 21,6 százalékát fizették a betegek a gyógyszer árának, ez a szám a 2009-re 24,8 százalékra emelkedett, az idei féléves adatok szerint pedig ez a szám már 25,5 százalék.