A Transparency International Magyarország mellett az Átlátszó ellen is átfogó vizsgálatot indított a Szuverenitásvédelmi Hivatal június 25-én, azzal az indokkal, hogy „a honlapján közzétett beszámolói alapján külföldről támogatott szervezetnek minősül, amelynek éves költségvetésében a külföldi támogatások aránya jelentős”, és „a külföldről származó támogatás felhasználásával a választói akarat befolyásolására irányuló tevékenységet folytatnak, vagy ilyen tevékenységet támogatnak” – írja az Átlátszó.

Az Átlátszónak küldött hivatalos levélben a hivatal 11 kérdésre vár választ. Ezek egy része bárki számára megismerhető adatokra vonatkozik, más része a könyveléssel kapcsolatos információkat kér, harmadik része pedig a nemzetközi donor szervezetektől kapott támogatásokkal kapcsolatos.

Az Átlátszó azonban válaszában cáfolta, hogy válaszadási kötelezettsége lenne a feltett kérdésekre, hiszen „a választói akarat befolyásolására irányuló tevékenység” a pártpolitikai vagy önkormányzati politikai ügyekben kifejtett politikai kampánytevékenységet jelent, az Átlátszó pedig nem folytat ilyen tevékenységet.

Ezért felhívták a hivatal figyelmét arra, hogy csak olyan információkat osztanak meg a hivatallal, amelyeket bárki más megkeresésére is megadnának, azok pedig a honlapjukon is elérhetők.