Szolnok megyében, Nógrádban, Zalában és Hajdú-Biharban is észlelték a barnarothadást okozó kórokozót. A fertőzött növények termése semmilyen káros hatással nincs az emberekre és az állatokra sem. Azaz ezek felhasználhatók mind étkezési, mind takarmányozási, mind más ipari jellegű tevékenység, például keményítő gyártás céljára is. Egyetlen kritérium van, hogy a hulladékot meg kell semmisíteni, hogy az ne veszélyeztesse az egészséges növényeket.

A kórokozó az Európai Unióból került Magyarországra mintegy egy évtizede. Az ellene való védekezés pedig azért fontos, mert a termelést - így az ellátás biztonságát is - veszélyezteti egy esetleges nagyobb méretű fertőzés az országban. Azaz adott esetben esetleg nem lesz elég burgonya, paprika és paradicsom az országban, ha a hatóságok és a gazdálkodók nem körültekintően járnak el az ügyben, és a fertőzés széles körben elterjed. Ezért is nevezik a barnarothadás baktériumát zárlati kórokozónak, mivel a területeket, amelyeken ezt a baktériumot észlelik, növényegészségügyi zárlat alá kell vonni.

A kórokozó ellen elsősorban a gazdanövény, a keserű csucsor kiirtásával lehet védekezni. Az öntözést pedig adott körzetekben azért kell megtiltani, mert a kórokozó a vízbe kerülve és azt öntözésre felhasználva terjed leginkább, és veszélyezteti a termőkörzeteket. Emellett persze fertőtlenítéssel és más korszerű agrotechnikai eljárásokkal is lehet védekezni, ám ezek többsége drága, például az ultraviola fénnyel való besugárzás.
2008-ban a Burgonyakutatási Központ keszthelyi telepén öntöztek a barnarothadás baktériumával fertőzött alsópáhoki övcsatorna vizéből. Az így megfertőzött vetőburgonyát pedig az egészségesek között tárolták. A zárlati kötelezettség miatt viszont az egész tételt meg kellett semmisíteni. Ez nemcsak 96 millió forint kárt okozott - mivel mintegy 500 tonnáról volt szó -, hanem veszélyeztette a tavalyi, de még az idei vetőgumó-ellátást is, mivel a megsemmisített mennyiség az országos vetőgumó-ellátás 12-15 százalékát tette ki. Az országos növényvédelmi főfelügyelő mindehhez még hozzátette, hogy a megsemmisített mennyiség helyett vélhetően az unióból hoztak be vetőburgonyát az országba.

Az unióban a Bizottság és sok tagország is árgus szemekkel figyeli, hogy mely területeken milyen fertőzés üti fel a fejét, ugyanis ez alapot jelenthet piacvédelmi intézkedések meghozatalára is. Ezért fontos, hogy a magyar növény-egészségügyi hatóság egzakt képpel rendelkezzen a fertőzésről, és azt ellenőrzés alatt tartva minél kisebb területre szorítsa vissza, hogy ne lehetetlenüljön el esetleg egyes termőkörzetek teljes termelése.