A 2007-2013 között megvalósítandó Balatoni Zászlóshajó Program célja a térség európai szintű versenyképességének javítása, illetve a Balaton és a környező táj egyedülálló természeti és kulturális adottságaira építve igényes, exkluzív üdülő-, lakó- és munkakörnyezet megteremtése.

Amennyiben a kormány elé terjesztett programot elfogadják, a mintegy 100 milliárd forintos támogatású beruházások segítségével igazi minőségi turistaparadicsommá fejlődhet a Balaton. A Balatoni Zászlóshajó Program keretein belül ugyanis a dinamikusabb, összehangolt turisztikai marketing mellett szerepel a szálláshelyek színvonalának fejlesztése is. Ebben a négycsillagos szállodai kapacitás fejlesztése éppúgy helyet kap, mint a jelenleg leromlott állapotú hotelek korszerűsítése.

A célkitűzések között szerepel még a gyógy- és termálvízhez kötődő turizmus fejlesztése, elsősorban a már meglévő fürdők (például Hévíz, Zalakaros, Balatonszemes, Tapolca) szolgáltatás-kínálatának bővítése, minőségi fellendítése. A strandfejlesztéseket, valamint a vitorlázás infrastrukturális feltételeinek javítását-erősítését szintén előtérbe helyezték a programban.

A tervekben nem feledkeznek meg a kiemelkedő turisztikai attrakciókról, látványosságokról sem, ezért támogatni kívánják a jövőben a tematikus élmény-, örökség- és kalandparkok (keszthelyi Helikon projekt, Siófok-Zamárdi szabadtéri témapark, illetve a Zánkai Gyermek Centrum korszerűsítése) létesítését is.